앤트로픽, 파지 유래 단백질 입자 첫 3차원 구조 분석

본문

클로드를 활용해 96개 단백질로 이뤄진 L05 입자의 구조를 재구성했다. 앤트로픽 (Anthropic)이 클로드의 도움을 받아 박테리오파지 유래 단백질로 조립한 vault 입자의 3차원 구조를 분석했다. vault는 속이 빈 단백질 껍질로, 1986년 처음 분리됐다. 포유류의 vault는 주요 단백질 78개가 두 반쪽을 이루는 구조다. 연구진은 후보 단백질 44개를 추려 세포 밖에서 먼저 시험했다. 전자현미경으로 관찰한 결과, 이 15개 단백질 가운데 7개가 vault 유사 입자로 조립됐다. 극저온 전자현미경에서는 이 중 4개의 vault 형태가 확인됐고, 파지 유래 단백질과 세균 유래 단백질이 각각 2개씩 포함됐다. 연구진은 닫힌 입자를 잘 형성한 파지 유래 L05를 상세 분석 대상으로 선정했다. L05 입자는 단백질 96개로 이뤄졌으며, 두 반쪽에 각각 48개씩 들어간다.

구조 지도에서는 L05 단백질 96개 각각의 한 부분에 작은 분자로 보이는 밀도가 나타났다.

클로드는 단백질 데이터베이스 검색과 DNA 설계, 입자 분리 방법 개선, 현미경 데이터 처리에 쓰였다. 연구진은 첫 전체 구조 모델이 데이터 처리 시작 34시간 뒤 나왔고, 최종 지도는 약 일주일 만에 완성됐다고 밝혔다.